養雞場內的污染物主要是養殖過程中產生的雞糞、臟墊草、污水、垃圾、病死雞等。它們是病原體的主要攜帶者，如果不做好無害化處理就會污染養雞場的環境，為疾病的發生埋下隱患。

一、雞糞(包括臟墊章)的處理

養雞場應建有與飼養規模相匹配的糞污收集設施、設備或處理(置)機制，糞便不得隨地堆積，廢水不得隨意排放。已建養雞場沒有處理設施或處理機制的，應予補建。從雞舍或運動場等清出的糞便要及時收集運送到貯存或處理場所。雞糞收集過程中必須采取防揚散、防流失、防滲漏等措施。

1、深坑腐熟處理

挖一長方形土坑，長、寬、高分別為2.2米、2.0米和0.5米，四周磚砌，水泥抹平，將雞糞70%、草粉30%混合均勻(含水量以手握指縫有水跡但無水珠滴下為宜)，堆積15～20厘米高，經過3周，冬季經過6周即可腐熟。這種方法對于含水量較高的雞糞處理效果較好。

2、EM菌液發酵法

用麥秸、稻草、樹葉、鋸末、稻殼等做雞舍墊料時，當雞舍內墊料使用超過2個月后，將墊料與雞糞的混合物清理出來(水分含量控制在35%左右)，加入EM菌液，之后堆積發酵。

（1）EM菌液的用量及配制方法

按500千克雞糞墊料混合物與400毫升EM菌液、400克紅糖的比例進行混合。具體方法是首先要確定處理雞糞混合物的量，再按比例計算出EM菌液和紅糖的用量，先用少量50℃左右的溫水把紅糖溶解，然后加適量冷開水稀釋，隨之加入所需EM菌液，并按處理雞糞及墊料量的5%加足清水，混勻待用。

（2）雞糞EM發酵方法

將收集的雞糞墊料混合物分層裝入發酵池內，每層20厘米厚，按比例噴灑EM稀釋菌液，每加一層料噴灑一次菌液，直至貯滿，用塑料薄膜密封發酵。在常溫情況下，雞糞的EM發酵只需3天，冬天需5～7天即可完成。EM發酵成功的雞糞，酸香味取代了臭味，雞糞表面有白色菌絲覆蓋。

3、堆積發酵

在一塊平地上將糞便堆積起來(如果糞便稀可以摻一些切短的麥秸或玉米秸)，然后在糞堆的表面用草泥糊嚴。必要時在糞便堆積的時候添加一些EM菌液。經過4～8周糞堆內部溫度在50℃以上，維持1周以上時間，糞便中的病原體即可被殺滅，尿酸鹽也會被分解。

二、污水的處理

養雞場的污水要通過專用管道排放，在養雞場圍墻外、下風向處設置污水池，污水池要用水泥硬化，減少向地下的滲透。最好按照沼氣池的建造要求，利用污水產生沼氣。沼氣可以用于加熱或照明，沼液用于灌溉。

三、病死雞的尸體處理

死亡的病雞尸體要及時、專門處理，不得在養雞場(小區)內外隨地丟棄。病死雞尸體的處理應采用專用焚燒爐焚燒的辦法，焚燒時應采取凈化措施，防止對周邊大氣環境造成污染。不具備焚燒條件的養雞場應設置兩個以上安全填埋井，填埋井應為混凝土結構，深度大于2米，直徑不小于0.7米，井口加蓋密封。進行填埋時，每次投入病雞尸體后，應覆蓋一層厚度大于3厘米的生石灰，井填滿后(病雞尸體距井口處約70厘米)，須用黏土填壓實并密封井口。有的養雞場在偏僻的角落處修建幾間易豬舍，在豬舍旁建一爐灶，每天上午、下午把死亡的雞只丟進大鍋內高溫煮沸，經過1小時后撈出、放涼后與飼料摻在一起喂豬。這種做法也能夠使病死雞攜帶的病原體被殺滅。但是，從食品質量安全角度看，不提倡這樣做。